Protein–RNA interactions for Protein: P61026

RAB10, Ras-related protein Rab-10, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB10P61026 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB10P61026 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RAB10P61026 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB10P61026 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB10P61026 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB10P61026 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB10P61026 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB10P61026 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB10P61026 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB10P61026 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB10P61026 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB10P61026 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB10P61026 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB10P61026 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB10P61026 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB10P61026 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB10P61026 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB10P61026 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB10P61026 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB10P61026 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB10P61026 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB10P61026 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB10P61026 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB10P61026 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB10P61026 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB10P61026 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB10P61026 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB10P61026 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB10P61026 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB10P61026 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB10P61026 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB10P61026 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB10P61026 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB10P61026 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB10P61026 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms