Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NUP107P57740 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NUP107P57740 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NUP107P57740 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NUP107P57740 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NUP107P57740 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms