Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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PGGT1BP53609 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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PGGT1BP53609 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PGGT1BP53609 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PGGT1BP53609 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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