Protein–RNA interactions for Protein: P53597

SUCLG1, Succinate--CoA ligase [ADP/GDP-forming] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG1P53597 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SUCLG1P53597 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SUCLG1P53597 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms