Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HK3P52790 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
HK3P52790 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HK3P52790 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HK3P52790 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HK3P52790 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HK3P52790 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
HK3P52790 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HK3P52790 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
HK3P52790 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
HK3P52790 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HK3P52790 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HK3P52790 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HK3P52790 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HK3P52790 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HK3P52790 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HK3P52790 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HK3P52790 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HK3P52790 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HK3P52790 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HK3P52790 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
HK3P52790 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HK3P52790 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HK3P52790 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HK3P52790 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HK3P52790 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms