Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GTF2A1P52655 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF2A1P52655 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms