Protein–RNA interactions for Protein: P51151

RAB9A, Ras-related protein Rab-9A, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9AP51151 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
RAB9AP51151 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RAB9AP51151 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms