Protein–RNA interactions for Protein: P50458

LHX2, LIM/homeobox protein Lhx2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX2P50458 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX2P50458 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX2P50458 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX2P50458 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX2P50458 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX2P50458 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX2P50458 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX2P50458 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX2P50458 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX2P50458 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX2P50458 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX2P50458 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX2P50458 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX2P50458 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX2P50458 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX2P50458 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LHX2P50458 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LHX2P50458 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LHX2P50458 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
LHX2P50458 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX2P50458 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX2P50458 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX2P50458 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX2P50458 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX2P50458 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX2P50458 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX2P50458 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX2P50458 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX2P50458 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX2P50458 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX2P50458 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX2P50458 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX2P50458 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX2P50458 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX2P50458 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX2P50458 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX2P50458 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX2P50458 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX2P50458 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX2P50458 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX2P50458 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX2P50458 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX2P50458 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX2P50458 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LHX2P50458 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX2P50458 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX2P50458 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX2P50458 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX2P50458 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX2P50458 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX2P50458 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX2P50458 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX2P50458 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX2P50458 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX2P50458 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX2P50458 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX2P50458 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX2P50458 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX2P50458 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX2P50458 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX2P50458 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX2P50458 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX2P50458 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX2P50458 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX2P50458 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX2P50458 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX2P50458 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX2P50458 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX2P50458 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
LHX2P50458 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms