Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
GSK3BP49841 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
GSK3BP49841 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms