Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RGS4P49798 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RGS4P49798 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGS4P49798 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGS4P49798 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGS4P49798 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RGS4P49798 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RGS4P49798 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RGS4P49798 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGS4P49798 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGS4P49798 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGS4P49798 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGS4P49798 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGS4P49798 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGS4P49798 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGS4P49798 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGS4P49798 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGS4P49798 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGS4P49798 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGS4P49798 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGS4P49798 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGS4P49798 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGS4P49798 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGS4P49798 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGS4P49798 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGS4P49798 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGS4P49798 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RGS4P49798 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RGS4P49798 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RGS4P49798 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGS4P49798 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGS4P49798 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGS4P49798 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGS4P49798 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGS4P49798 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGS4P49798 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGS4P49798 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RGS4P49798 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms