Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEDD4P46934 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms