Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GRIA2P42262 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
GRIA2P42262 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms