Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ACTR1BP42025 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ACTR1BP42025 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms