Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HOXD13P35453 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms