Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COL4A5P29400 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
COL4A5P29400 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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