Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2E1P29083 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms