Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD34P28906 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD34P28906 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD34P28906 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD34P28906 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms