Protein–RNA interactions for Protein: P25067

COL8A2, Collagen alpha-2(VIII) chain, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL8A2P25067 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COL8A2P25067 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COL8A2P25067 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms