Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTPRGP23470 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTPRGP23470 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
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