Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTGS1P23219 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTGS1P23219 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms