Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CD247P20963 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CD247P20963 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CD247P20963 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms