Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
EFNA1P20827 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms