Protein–RNA interactions for Protein: P17538

CTRB1, Chymotrypsinogen B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTRB1P17538 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CTRB1P17538 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms