Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CREB1P16220 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CREB1P16220 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CREB1P16220 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CREB1P16220 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CREB1P16220 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CREB1P16220 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CREB1P16220 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CREB1P16220 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CREB1P16220 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CREB1P16220 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CREB1P16220 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms