Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRIM27P14373 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms