Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRG2P13727 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRG2P13727 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PRG2P13727 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRG2P13727 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRG2P13727 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRG2P13727 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRG2P13727 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRG2P13727 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRG2P13727 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRG2P13727 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRG2P13727 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRG2P13727 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRG2P13727 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRG2P13727 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRG2P13727 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRG2P13727 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRG2P13727 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRG2P13727 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRG2P13727 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRG2P13727 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms