Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
DEFA4P12838 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
DEFA4P12838 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
DEFA4P12838 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA4P12838 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA4P12838 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA4P12838 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA4P12838 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA4P12838 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA4P12838 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA4P12838 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA4P12838 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA4P12838 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA4P12838 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA4P12838 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA4P12838 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA4P12838 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA4P12838 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA4P12838 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DEFA4P12838 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.03■□□□□ -0
DEFA4P12838 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA4P12838 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA4P12838 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA4P12838 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA4P12838 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA4P12838 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA4P12838 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA4P12838 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
DEFA4P12838 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms