Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
VPREB1P12018 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms