Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOP1P11387 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOP1P11387 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TOP1P11387 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TOP1P11387 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TOP1P11387 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP1P11387 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP1P11387 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP1P11387 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP1P11387 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP1P11387 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP1P11387 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP1P11387 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP1P11387 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP1P11387 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP1P11387 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP1P11387 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP1P11387 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP1P11387 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP1P11387 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP1P11387 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP1P11387 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP1P11387 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP1P11387 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP1P11387 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP1P11387 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TOP1P11387 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP1P11387 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP1P11387 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP1P11387 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP1P11387 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP1P11387 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP1P11387 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP1P11387 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP1P11387 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP1P11387 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP1P11387 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP1P11387 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP1P11387 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP1P11387 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP1P11387 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP1P11387 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP1P11387 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP1P11387 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP1P11387 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP1P11387 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP1P11387 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP1P11387 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP1P11387 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TOP1P11387 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOP1P11387 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOP1P11387 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOP1P11387 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOP1P11387 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOP1P11387 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOP1P11387 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOP1P11387 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOP1P11387 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TOP1P11387 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOP1P11387 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOP1P11387 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TOP1P11387 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOP1P11387 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOP1P11387 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOP1P11387 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOP1P11387 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOP1P11387 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOP1P11387 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOP1P11387 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOP1P11387 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TOP1P11387 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TOP1P11387 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms