Protein–RNA interactions for Protein: P10606

COX5B, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5BP10606 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COX5BP10606 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COX5BP10606 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
COX5BP10606 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX5BP10606 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX5BP10606 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX5BP10606 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX5BP10606 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX5BP10606 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX5BP10606 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX5BP10606 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX5BP10606 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
COX5BP10606 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms