Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI3P10071 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI3P10071 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI3P10071 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI3P10071 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI3P10071 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI3P10071 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI3P10071 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI3P10071 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI3P10071 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI3P10071 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI3P10071 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI3P10071 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI3P10071 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GLI3P10071 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI3P10071 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI3P10071 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI3P10071 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI3P10071 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI3P10071 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI3P10071 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI3P10071 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI3P10071 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI3P10071 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI3P10071 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI3P10071 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI3P10071 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI3P10071 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI3P10071 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI3P10071 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GLI3P10071 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI3P10071 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI3P10071 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI3P10071 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI3P10071 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI3P10071 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI3P10071 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI3P10071 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI3P10071 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI3P10071 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI3P10071 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI3P10071 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI3P10071 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GLI3P10071 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GLI3P10071 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GLI3P10071 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GLI3P10071 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GLI3P10071 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GLI3P10071 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
GLI3P10071 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
GLI3P10071 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI3P10071 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI3P10071 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI3P10071 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI3P10071 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI3P10071 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI3P10071 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI3P10071 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI3P10071 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI3P10071 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI3P10071 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI3P10071 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI3P10071 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI3P10071 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI3P10071 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI3P10071 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI3P10071 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI3P10071 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI3P10071 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI3P10071 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI3P10071 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI3P10071 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI3P10071 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI3P10071 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GLI3P10071 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI3P10071 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI3P10071 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI3P10071 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI3P10071 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI3P10071 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI3P10071 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI3P10071 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI3P10071 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI3P10071 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI3P10071 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI3P10071 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI3P10071 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI3P10071 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI3P10071 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI3P10071 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI3P10071 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI3P10071 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI3P10071 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI3P10071 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GLI3P10071 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI3P10071 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI3P10071 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI3P10071 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI3P10071 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GLI3P10071 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms