Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TMEM225BP0DP42 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TMEM225BP0DP42 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms