Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXB7P09629 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HOXB7P09629 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms