Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP3P08254 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP3P08254 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP3P08254 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP3P08254 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP3P08254 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP3P08254 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP3P08254 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP3P08254 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP3P08254 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP3P08254 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP3P08254 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP3P08254 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP3P08254 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP3P08254 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP3P08254 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP3P08254 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP3P08254 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP3P08254 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP3P08254 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP3P08254 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP3P08254 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP3P08254 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP3P08254 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP3P08254 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP3P08254 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MMP3P08254 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MMP3P08254 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MMP3P08254 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MMP3P08254 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MMP3P08254 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MMP3P08254 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MMP3P08254 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MMP3P08254 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MMP3P08254 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MMP3P08254 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MMP3P08254 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
MMP3P08254 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MMP3P08254 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MMP3P08254 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MMP3P08254 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MMP3P08254 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MMP3P08254 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MMP3P08254 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MMP3P08254 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MMP3P08254 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MMP3P08254 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MMP3P08254 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MMP3P08254 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MMP3P08254 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MMP3P08254 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MMP3P08254 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MMP3P08254 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MMP3P08254 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MMP3P08254 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MMP3P08254 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MMP3P08254 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MMP3P08254 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MMP3P08254 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MMP3P08254 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MMP3P08254 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MMP3P08254 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MMP3P08254 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MMP3P08254 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MMP3P08254 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MMP3P08254 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MMP3P08254 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MMP3P08254 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MMP3P08254 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MMP3P08254 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
MMP3P08254 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MMP3P08254 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms