Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
KLK3P07288 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
KLK3P07288 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLK3P07288 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLK3P07288 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms