Protein–RNA interactions for Protein: P00746

CFD, Complement factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP00746 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CFDP00746 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CFDP00746 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CFDP00746 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms