Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MAP4K4O95819 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms