Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNSO60931 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CTNSO60931 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CTNSO60931 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CTNSO60931 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CTNSO60931 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms