Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GRIN3BO60391 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GRIN3BO60391 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms