Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SMARCA5O60264 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms