Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CXCL13O43927 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CXCL13O43927 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms