Protein–RNA interactions for Protein: O43822

C21orf2, Protein C21orf2, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C21orf2O43822 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C21orf2O43822 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C21orf2O43822 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C21orf2O43822 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C21orf2O43822 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C21orf2O43822 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C21orf2O43822 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C21orf2O43822 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C21orf2O43822 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C21orf2O43822 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C21orf2O43822 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C21orf2O43822 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C21orf2O43822 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C21orf2O43822 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C21orf2O43822 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C21orf2O43822 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C21orf2O43822 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms