Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SSNA1O43805 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SSNA1O43805 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms