Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
EBAG9O00559 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
EBAG9O00559 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms