Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SNAP23O00161 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SNAP23O00161 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms