Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
J3KR12 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
J3KR12 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
J3KR12 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
J3KR12 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms