Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms