Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RGPD3A6NKT7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RGPD3A6NKT7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms