Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
MEIS3P1A6NDR6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms