Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
USH1CQ9Y6N9 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms